Система роботи Тернопільської спеціалізованої школи І-ІІІ ступенів № 3 з поглибленим вивченням іноземних мов підтримує партнерські зв’язки з міжнародними освітніми організаціями та вищими навчальними закладами М.Тернополя, що сприяє забезпеченню результативності діяльності школи, формуванню конкурентоспроможної особистості, здатної перетворювати набуті знання в продукти практичної діяльності. Така система є ефективною, оскільки   зорієнтована на кінцевий результат. 

Школа співпрацює з:

• Міжнародним університетом LCC (м. Клайпеда, Литва)
• Освітньою організацією O.W.L. (Open World Learning)
• Тернопільським національним університетом ім. В. Гнатюка
• Тернопільським національним економічним університетом.

Міжнародний університет LCC (м. Клайпеда, Литва):

• участь учителів школи у міжнародних конференціях в м. Клайпеда;
• профорієнтаційна робота, презентація університету представниками закладу;
• проведення  тестування учнів за програмою TOEFL/ IELTS;
• навчання випускників школи в університеті.

Освітня організація O.W.L. (Open World Learning, м. Ванкувер, Канада):

• профорієнтаційна робота,знайомство з вищими навчальними закладами країн Європи, Канади, США;
• навчання учнів в літніх мовних школах

Тернопільський національний університет ім.В. Гнатюка:

• проходження педпрактики студентами педвузу на базі школи;
• директор школи Петрокушин Р.В. була стейкхолдером (як роботодавець) під час акредитації освітньої програми 014.12 Середня освіта (Образотворче мистецтво);
• участь вчителів школи у науково-практичних  конференціях;
• участь учнів старших класів у практичних семінарах, тренінгах та заходах, які організовуються і проводяться на базі університету.

Західноукраїнський національний університет:

• організація зустрічей та практичних занять для учнів старших класів з волонтерами Корпусу миру, які працюють в університеті;
• участь учнів школи у конкурсах, олімпіадах, інтелектуальних турнірах, змаганнях, які організовуються на базі університету.
• участь вчителів школи у науково-практичних конференціях, семінарах, тренінгах, які організовуються і проводяться на базі університету;

З вересня 2018 року школа бере участь у проекті «Шкільний вчитель нового покоління», який реалізовується за підтримки Британської Ради в Україні та МОН України у Тернопільському  національному педагогічному університеті імені Володимира Гнатюка. Проект спрямовано на реформування системи професійної підготовки вчителя англійської мови, оновлення змісту програми з методики навчання англійської мови, перенесення акценту на практичну підготовку вчителя і розвиток рефлексії.

Декілька років поспіль учні школи є учасниками  відкритого Західноукраїнського інтелектуального турніру «Natus vincere» на кубок ректора ТНЕУ.  Наші учні є щорічними переможцями  в соціально-психологічній та правовій секції.